我校植物学科，依托云南得天独厚的植物多样性优势，在秦仁昌、严楚江等著名植物学家30年代以来开创的学科基础上，以孙必兴、朱维明等教授领衔的一批学者在植物学各领域展开研究，参编了《中国植物志》、《中国植被》、《云南植物志》等多部著作，在全国已有较大影响。该学科作为云南省重点学科、国家理科人才培养基地和国家“211工程”大学重点学科方向建设后，在人才培养引进、梯队建设和实验设备方面已有显著发展和特色，目前已形成了三个稳定的研究方向：（1）植物分类与资源学方向：蕨类分类、禾草分类研究基础较强。近十多年来一批年轻学者从种群生态、繁育和分子生物学等方面研究关键类群的系统进化与种质资源保护，产生了相当影响。（2）植物遗传育种与基因工程是我校近期兴起和迅速发展的研究方向。在麻类作物育种、水稻高产转基因育种、烟草品种抗病性基因工程育种方面的研究居国内先进水平，取得了较好的社会效益和经济效益。（3）植物生理学与分子生物学方向：植物抗逆性的生理与分子生物学研究是也是植物学科的重要研究方向，采用现代先进技术和学科手段，对解决农林业生产实践问题具有重大理论意义和广泛的发展前景，已产生了相当的影响。 该植物学科在岗教授8人、副教授5人、讲师5人，大多数具有博士和硕士学位。已在我学院的植物学、水生生物学、遗传学和发育生物学4个博士点担任博士导师的植物学科教授共6人。近五年承担国家级重点项目2项、国家自然科学基金项目10项、云南省重点项目2项、云南省攻关项目2项、云南省基金项目18项，科研经费计500余万元。发表论文160余篇，SCI 收录 7篇。获国家级奖2项、省部级奖10余项。 云南植物物种多样性资源优势和云南在本世纪“建设绿色经济强省战略”发展及我国“西部大开发战略”发展都亟需大量综合性的植物学高层次人才。该学科各方向具有优厚的条件和实力，具备从本科、硕士、博士到博士后的植物学人才培养体系。